همچنین، در رتبه‌بندی ادغام‌شده دانشگاه‌های کشور، شامل تمامی دانشگاه‌های جامع، صنعتی، کشاورزی و هنر، دانشگاه تهران رتبه نخست ملی را به خود اختصاص داده است.

این رتبه‌بندی مطابق روش‌شناسی مصوب شورای گسترش آموزش عالی وزارت علوم، تحقیقات و فناوری، بر اساس شش معیار آموزش با وزن ۲۵ درصد، پژوهش با وزن ۲۰ درصد، فناوری و نوآوری با وزن ۱۵ درصد، مرجعیت و دیپلماسی علمی و فناوری با وزن ۱۵ درصد، فرهنگی-اجتماعی و دانشجویی با وزن ۱۵ درصد و مدیریت و بهره‌وری با وزن ۱۰ درصد انجام شده است.

در رتبه‌بندی جداگانه بر اساس هر یک از این معیار‌ها نیز دانشگاه تهران در سه معیار آموزش، پژوهش و دیپلماسی علمی برترین دانشگاه جامع و در معیار فناوری و نوآوری دومین دانشگاه جامع کشور شده است.